伊势贞孝等人倒是苦苦相求，希望根来寺快秀能继续留下与幕府军作战。而根来寺快秀这次是领教了越后之龙的厉害，他可不想继续留在京都这种最危险的地方。随后双方便不欢而散。伊势贞孝只能带着其子伊势贞良还有同族的伊势因幡守、伊势备中守、伊势贞知、伊势贞运和伊势宫千代等还有一千军势离开了淀城，返回中尾城据守。
谦信可不会让伊势贞孝活过这天，迅速与京都的奉公众们合流后以七千军势再次兵临中尾城下，并且以怒涛之势发起了总攻。不少伊势家的兵士在惊恐中四散而逃。很快，中尾城的西之丸、北之丸、二之丸纷纷被攻下，伊势贞孝等人只能据守在本丸的二层天守阁内准备负隅顽抗。
“看来我等是活不过今天了······”坐在大广间里的伊势贞孝苦笑道。
“殿下，我等不是输给了幕府，而是输给了上杉谦信！”伊势贞知不甘心的说道。
“确实，‘强情公方’在京畿的势力形同虚设，然而在上杉谦信的统辖下，幕府军却能接连将我军与根来众击溃。”伊势备中守表示同意伊势贞知的看法。
“父亲大人，此刻幕府军停下了攻击说不定是给我等切腹的时间······”伊势贞良转身看着身后年幼的伊势贞为和伊势贞兴后咬着牙说道。
“把孩子送出去吧，我等在这里切腹。”伊势贞孝发现了伊势贞良的心思。他清楚谦信既然获得了大胜必然不会过于为难两个孩子，只要把他们送到松永久秀处就还能延续伊势家的血脉。
“是。”
随后，伊势贞孝、伊势因幡守、伊势备中守、伊势贞知、伊势贞运、伊势宫千代等先后在大广间内切腹自害。当伊势贞为和伊势贞兴这两个孩子被送出来时幕府军便冲进了本丸，将伊势贞孝等人的首级斩下。而后，谦信并没有想加害两个孩子，只能将他们送到了松永久秀的多闻山城外。
伊势贞孝的死亡宣告了幕府内部的统一，也向三好、六角、畠山等大名展现了幕府的实力。谦信本人也有所得——被任命为政所执事、御相伴众，并且新增北陆（若狭、越前、加贺、能登、越中、越后、佐渡）探题一职也由谦信担任。